Protein–RNA interactions for Protein: Q16534

HLF, Hepatic leukemia factor, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLFQ16534 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HLFQ16534 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HLFQ16534 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HLFQ16534 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HLFQ16534 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HLFQ16534 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HLFQ16534 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HLFQ16534 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HLFQ16534 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HLFQ16534 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HLFQ16534 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HLFQ16534 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HLFQ16534 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HLFQ16534 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
HLFQ16534 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HLFQ16534 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HLFQ16534 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
HLFQ16534 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HLFQ16534 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HLFQ16534 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HLFQ16534 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HLFQ16534 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HLFQ16534 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HLFQ16534 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HLFQ16534 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HLFQ16534 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HLFQ16534 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HLFQ16534 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HLFQ16534 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HLFQ16534 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HLFQ16534 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
HLFQ16534 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HLFQ16534 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLFQ16534 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLFQ16534 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLFQ16534 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLFQ16534 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLFQ16534 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLFQ16534 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLFQ16534 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLFQ16534 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLFQ16534 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLFQ16534 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HLFQ16534 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLFQ16534 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLFQ16534 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLFQ16534 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HLFQ16534 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLFQ16534 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLFQ16534 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HLFQ16534 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLFQ16534 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLFQ16534 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLFQ16534 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLFQ16534 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HLFQ16534 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLFQ16534 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLFQ16534 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HLFQ16534 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLFQ16534 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLFQ16534 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLFQ16534 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLFQ16534 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLFQ16534 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HLFQ16534 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLFQ16534 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLFQ16534 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLFQ16534 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLFQ16534 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLFQ16534 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLFQ16534 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HLFQ16534 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLFQ16534 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLFQ16534 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLFQ16534 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLFQ16534 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HLFQ16534 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLFQ16534 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLFQ16534 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLFQ16534 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLFQ16534 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HLFQ16534 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLFQ16534 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLFQ16534 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLFQ16534 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLFQ16534 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HLFQ16534 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLFQ16534 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLFQ16534 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLFQ16534 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLFQ16534 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLFQ16534 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLFQ16534 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HLFQ16534 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HLFQ16534 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HLFQ16534 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HLFQ16534 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HLFQ16534 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HLFQ16534 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HLFQ16534 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms