Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GRIK5Q16478 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
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