Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITSN1Q15811 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ITSN1Q15811 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITSN1Q15811 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITSN1Q15811 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITSN1Q15811 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITSN1Q15811 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITSN1Q15811 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITSN1Q15811 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITSN1Q15811 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITSN1Q15811 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITSN1Q15811 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ITSN1Q15811 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITSN1Q15811 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ITSN1Q15811 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITSN1Q15811 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITSN1Q15811 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITSN1Q15811 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ITSN1Q15811 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITSN1Q15811 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITSN1Q15811 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ITSN1Q15811 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITSN1Q15811 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITSN1Q15811 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITSN1Q15811 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITSN1Q15811 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITSN1Q15811 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITSN1Q15811 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITSN1Q15811 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITSN1Q15811 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ITSN1Q15811 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITSN1Q15811 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITSN1Q15811 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITSN1Q15811 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
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