Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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SIX1Q15475 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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SIX1Q15475 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SIX1Q15475 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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