Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CAPSQ13938 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CAPSQ13938 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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