Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMB3Q13751 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms