Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CUL3Q13618 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CUL3Q13618 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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