Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DNASE1L3Q13609 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms