Protein–RNA interactions for Protein: Q13569

TDG, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDGQ13569 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TDGQ13569 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TDGQ13569 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TDGQ13569 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TDGQ13569 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TDGQ13569 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TDGQ13569 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TDGQ13569 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TDGQ13569 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TDGQ13569 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TDGQ13569 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TDGQ13569 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TDGQ13569 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TDGQ13569 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TDGQ13569 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TDGQ13569 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TDGQ13569 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TDGQ13569 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TDGQ13569 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TDGQ13569 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TDGQ13569 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TDGQ13569 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TDGQ13569 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TDGQ13569 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TDGQ13569 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TDGQ13569 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TDGQ13569 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TDGQ13569 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TDGQ13569 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TDGQ13569 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDGQ13569 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDGQ13569 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDGQ13569 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDGQ13569 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDGQ13569 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDGQ13569 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDGQ13569 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDGQ13569 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDGQ13569 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDGQ13569 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDGQ13569 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDGQ13569 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDGQ13569 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDGQ13569 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDGQ13569 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDGQ13569 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDGQ13569 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDGQ13569 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDGQ13569 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDGQ13569 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDGQ13569 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDGQ13569 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDGQ13569 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDGQ13569 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDGQ13569 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDGQ13569 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDGQ13569 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDGQ13569 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDGQ13569 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDGQ13569 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDGQ13569 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDGQ13569 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDGQ13569 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDGQ13569 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDGQ13569 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TDGQ13569 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TDGQ13569 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TDGQ13569 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TDGQ13569 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TDGQ13569 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TDGQ13569 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TDGQ13569 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TDGQ13569 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TDGQ13569 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TDGQ13569 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TDGQ13569 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TDGQ13569 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TDGQ13569 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TDGQ13569 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TDGQ13569 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TDGQ13569 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TDGQ13569 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TDGQ13569 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TDGQ13569 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TDGQ13569 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TDGQ13569 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TDGQ13569 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TDGQ13569 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TDGQ13569 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TDGQ13569 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TDGQ13569 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TDGQ13569 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TDGQ13569 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TDGQ13569 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TDGQ13569 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TDGQ13569 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TDGQ13569 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TDGQ13569 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TDGQ13569 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TDGQ13569 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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