Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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SGCGQ13326 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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SGCGQ13326 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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SGCGQ13326 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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SGCGQ13326 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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SGCGQ13326 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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SGCGQ13326 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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SGCGQ13326 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SGCGQ13326 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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