Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLAMF1Q13291 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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