Protein–RNA interactions for Protein: Q13045

FLII, Protein flightless-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLIIQ13045 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FLIIQ13045 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FLIIQ13045 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FLIIQ13045 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FLIIQ13045 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FLIIQ13045 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FLIIQ13045 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FLIIQ13045 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FLIIQ13045 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FLIIQ13045 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FLIIQ13045 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FLIIQ13045 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FLIIQ13045 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FLIIQ13045 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FLIIQ13045 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FLIIQ13045 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FLIIQ13045 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FLIIQ13045 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FLIIQ13045 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FLIIQ13045 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FLIIQ13045 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FLIIQ13045 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FLIIQ13045 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FLIIQ13045 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FLIIQ13045 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FLIIQ13045 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FLIIQ13045 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FLIIQ13045 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FLIIQ13045 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FLIIQ13045 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FLIIQ13045 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FLIIQ13045 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FLIIQ13045 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FLIIQ13045 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FLIIQ13045 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FLIIQ13045 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FLIIQ13045 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FLIIQ13045 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FLIIQ13045 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FLIIQ13045 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FLIIQ13045 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FLIIQ13045 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FLIIQ13045 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FLIIQ13045 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FLIIQ13045 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FLIIQ13045 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FLIIQ13045 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FLIIQ13045 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FLIIQ13045 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FLIIQ13045 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FLIIQ13045 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FLIIQ13045 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FLIIQ13045 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FLIIQ13045 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FLIIQ13045 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FLIIQ13045 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FLIIQ13045 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FLIIQ13045 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FLIIQ13045 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FLIIQ13045 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FLIIQ13045 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FLIIQ13045 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FLIIQ13045 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FLIIQ13045 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
FLIIQ13045 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FLIIQ13045 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FLIIQ13045 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FLIIQ13045 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FLIIQ13045 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FLIIQ13045 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FLIIQ13045 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FLIIQ13045 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FLIIQ13045 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FLIIQ13045 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FLIIQ13045 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FLIIQ13045 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FLIIQ13045 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FLIIQ13045 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FLIIQ13045 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FLIIQ13045 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FLIIQ13045 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FLIIQ13045 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FLIIQ13045 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FLIIQ13045 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FLIIQ13045 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FLIIQ13045 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FLIIQ13045 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FLIIQ13045 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FLIIQ13045 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FLIIQ13045 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FLIIQ13045 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FLIIQ13045 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FLIIQ13045 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FLIIQ13045 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FLIIQ13045 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FLIIQ13045 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FLIIQ13045 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FLIIQ13045 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FLIIQ13045 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FLIIQ13045 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms