Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CSTF3Q12996 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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