Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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FOXC1Q12948 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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FOXC1Q12948 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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FOXC1Q12948 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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FOXC1Q12948 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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FOXC1Q12948 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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FOXC1Q12948 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXC1Q12948 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXC1Q12948 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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