Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRJQ12913 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.1 ms