Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHD3Q12873 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHD3Q12873 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHD3Q12873 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHD3Q12873 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHD3Q12873 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHD3Q12873 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHD3Q12873 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHD3Q12873 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHD3Q12873 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHD3Q12873 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHD3Q12873 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHD3Q12873 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHD3Q12873 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHD3Q12873 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHD3Q12873 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHD3Q12873 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHD3Q12873 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHD3Q12873 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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CHD3Q12873 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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CHD3Q12873 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHD3Q12873 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHD3Q12873 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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CHD3Q12873 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHD3Q12873 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHD3Q12873 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHD3Q12873 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHD3Q12873 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CHD3Q12873 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CHD3Q12873 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CHD3Q12873 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CHD3Q12873 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHD3Q12873 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHD3Q12873 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHD3Q12873 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHD3Q12873 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CHD3Q12873 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHD3Q12873 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHD3Q12873 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHD3Q12873 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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CHD3Q12873 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHD3Q12873 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHD3Q12873 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHD3Q12873 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHD3Q12873 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHD3Q12873 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHD3Q12873 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHD3Q12873 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CHD3Q12873 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHD3Q12873 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHD3Q12873 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CHD3Q12873 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHD3Q12873 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHD3Q12873 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHD3Q12873 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHD3Q12873 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHD3Q12873 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CHD3Q12873 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHD3Q12873 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CHD3Q12873 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHD3Q12873 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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