Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TFCP2Q12800 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TFCP2Q12800 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TFCP2Q12800 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TFCP2Q12800 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TFCP2Q12800 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TFCP2Q12800 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TFCP2Q12800 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TFCP2Q12800 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TFCP2Q12800 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TFCP2Q12800 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TFCP2Q12800 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TFCP2Q12800 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TFCP2Q12800 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TFCP2Q12800 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TFCP2Q12800 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TFCP2Q12800 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TFCP2Q12800 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TFCP2Q12800 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TFCP2Q12800 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TFCP2Q12800 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TFCP2Q12800 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TFCP2Q12800 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TFCP2Q12800 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TFCP2Q12800 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TFCP2Q12800 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TFCP2Q12800 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TFCP2Q12800 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TFCP2Q12800 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TFCP2Q12800 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TFCP2Q12800 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TFCP2Q12800 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TFCP2Q12800 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TFCP2Q12800 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TFCP2Q12800 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms