Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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RASGEF1BQ0VAM2 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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RASGEF1BQ0VAM2 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RASGEF1BQ0VAM2 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RASGEF1BQ0VAM2 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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