Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACSM1Q08AH1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms