Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PUDPQ08623 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms