Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 NDUFA5-212ENST00000618945 1432 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 FGF21-201ENST00000222157 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 AC124947.1-201ENST00000552835 814 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 AC026254.4-201ENST00000581118 454 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 AL365259.1-201ENST00000606334 509 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 LINC00959-202ENST00000637128 826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 AC119674.1-217ENST00000641942 1086 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 RNASE4-201ENST00000397995 853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 AC131934.1-201ENST00000527799 912 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 LINC01892-202ENST00000583985 540 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 AL049840.6-202ENST00000603373 279 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 LIAS-204ENST00000424936 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 HSPA8P3-201ENST00000449300 780 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 ZRANB2-AS1-202ENST00000450461 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 AC009502.2-201ENST00000452903 766 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 LINC01377-201ENST00000505396 649 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CACNB1Q02641 AL354872.2-201ENST00000607679 466 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms