Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCN7AQ01118 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SCN7AQ01118 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SCN7AQ01118 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SCN7AQ01118 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms