Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK3Q00526 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms