Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FAM3AP98173 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms