Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFNB1P98172 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms