Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HPCAP84074 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HPCAP84074 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HPCAP84074 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HPCAP84074 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HPCAP84074 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HPCAP84074 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HPCAP84074 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HPCAP84074 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HPCAP84074 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HPCAP84074 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HPCAP84074 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HPCAP84074 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HPCAP84074 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HPCAP84074 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HPCAP84074 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HPCAP84074 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HPCAP84074 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HPCAP84074 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HPCAP84074 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HPCAP84074 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HPCAP84074 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HPCAP84074 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HPCAP84074 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HPCAP84074 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HPCAP84074 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HPCAP84074 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HPCAP84074 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HPCAP84074 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HPCAP84074 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HPCAP84074 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HPCAP84074 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HPCAP84074 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HPCAP84074 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HPCAP84074 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HPCAP84074 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HPCAP84074 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HPCAP84074 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HPCAP84074 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HPCAP84074 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HPCAP84074 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HPCAP84074 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HPCAP84074 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HPCAP84074 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HPCAP84074 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HPCAP84074 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HPCAP84074 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HPCAP84074 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HPCAP84074 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HPCAP84074 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HPCAP84074 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HPCAP84074 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HPCAP84074 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HPCAP84074 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HPCAP84074 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HPCAP84074 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HPCAP84074 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HPCAP84074 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HPCAP84074 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HPCAP84074 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HPCAP84074 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HPCAP84074 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HPCAP84074 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HPCAP84074 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HPCAP84074 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HPCAP84074 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HPCAP84074 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HPCAP84074 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HPCAP84074 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HPCAP84074 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HPCAP84074 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HPCAP84074 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HPCAP84074 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HPCAP84074 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HPCAP84074 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HPCAP84074 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HPCAP84074 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HPCAP84074 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HPCAP84074 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HPCAP84074 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HPCAP84074 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HPCAP84074 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HPCAP84074 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HPCAP84074 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HPCAP84074 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HPCAP84074 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HPCAP84074 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HPCAP84074 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HPCAP84074 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HPCAP84074 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HPCAP84074 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HPCAP84074 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HPCAP84074 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HPCAP84074 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HPCAP84074 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HPCAP84074 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HPCAP84074 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HPCAP84074 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HPCAP84074 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HPCAP84074 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms