Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB25P57735 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB25P57735 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB25P57735 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB25P57735 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB25P57735 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAB25P57735 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB25P57735 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB25P57735 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB25P57735 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB25P57735 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB25P57735 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB25P57735 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB25P57735 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB25P57735 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB25P57735 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB25P57735 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB25P57735 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB25P57735 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB25P57735 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB25P57735 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB25P57735 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB25P57735 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB25P57735 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAB25P57735 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB25P57735 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB25P57735 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB25P57735 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB25P57735 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB25P57735 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAB25P57735 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB25P57735 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB25P57735 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB25P57735 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB25P57735 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB25P57735 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB25P57735 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB25P57735 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB25P57735 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB25P57735 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB25P57735 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB25P57735 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB25P57735 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB25P57735 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB25P57735 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB25P57735 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAB25P57735 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB25P57735 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAB25P57735 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAB25P57735 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB25P57735 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAB25P57735 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB25P57735 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB25P57735 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB25P57735 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB25P57735 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB25P57735 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB25P57735 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB25P57735 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB25P57735 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB25P57735 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB25P57735 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB25P57735 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB25P57735 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB25P57735 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB25P57735 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB25P57735 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB25P57735 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB25P57735 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB25P57735 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB25P57735 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB25P57735 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB25P57735 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB25P57735 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB25P57735 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB25P57735 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB25P57735 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB25P57735 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB25P57735 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAB25P57735 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB25P57735 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB25P57735 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAB25P57735 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAB25P57735 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB25P57735 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB25P57735 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB25P57735 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB25P57735 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB25P57735 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB25P57735 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB25P57735 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAB25P57735 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB25P57735 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAB25P57735 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB25P57735 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB25P57735 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB25P57735 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAB25P57735 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB25P57735 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAB25P57735 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms