Protein–RNA interactions for Protein: P57060

RWDD2B, RWD domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD2BP57060 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RWDD2BP57060 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms