Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TPTEP56180 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TPTEP56180 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TPTEP56180 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TPTEP56180 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TPTEP56180 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TPTEP56180 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TPTEP56180 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TPTEP56180 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TPTEP56180 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TPTEP56180 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TPTEP56180 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TPTEP56180 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TPTEP56180 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TPTEP56180 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TPTEP56180 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TPTEP56180 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TPTEP56180 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TPTEP56180 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TPTEP56180 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TPTEP56180 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TPTEP56180 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TPTEP56180 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TPTEP56180 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TPTEP56180 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TPTEP56180 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TPTEP56180 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TPTEP56180 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TPTEP56180 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TPTEP56180 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TPTEP56180 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TPTEP56180 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TPTEP56180 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TPTEP56180 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TPTEP56180 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TPTEP56180 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TPTEP56180 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TPTEP56180 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TPTEP56180 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TPTEP56180 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TPTEP56180 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TPTEP56180 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TPTEP56180 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TPTEP56180 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TPTEP56180 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TPTEP56180 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TPTEP56180 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TPTEP56180 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TPTEP56180 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TPTEP56180 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TPTEP56180 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TPTEP56180 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TPTEP56180 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TPTEP56180 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TPTEP56180 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TPTEP56180 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TPTEP56180 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TPTEP56180 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TPTEP56180 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TPTEP56180 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TPTEP56180 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TPTEP56180 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TPTEP56180 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TPTEP56180 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TPTEP56180 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TPTEP56180 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TPTEP56180 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TPTEP56180 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TPTEP56180 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TPTEP56180 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TPTEP56180 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TPTEP56180 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TPTEP56180 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TPTEP56180 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TPTEP56180 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TPTEP56180 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TPTEP56180 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TPTEP56180 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TPTEP56180 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TPTEP56180 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TPTEP56180 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TPTEP56180 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TPTEP56180 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TPTEP56180 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TPTEP56180 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TPTEP56180 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TPTEP56180 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TPTEP56180 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TPTEP56180 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TPTEP56180 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TPTEP56180 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TPTEP56180 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TPTEP56180 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TPTEP56180 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TPTEP56180 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TPTEP56180 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TPTEP56180 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TPTEP56180 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TPTEP56180 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TPTEP56180 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms