Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SH3BGRP55822 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms