Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP9P55211 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP9P55211 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP9P55211 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP9P55211 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP9P55211 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP9P55211 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP9P55211 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP9P55211 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP9P55211 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP9P55211 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP9P55211 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP9P55211 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP9P55211 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP9P55211 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP9P55211 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP9P55211 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP9P55211 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP9P55211 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP9P55211 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP9P55211 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP9P55211 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP9P55211 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP9P55211 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP9P55211 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP9P55211 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP9P55211 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP9P55211 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP9P55211 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP9P55211 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP9P55211 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP9P55211 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP9P55211 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP9P55211 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP9P55211 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP9P55211 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP9P55211 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP9P55211 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP9P55211 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP9P55211 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP9P55211 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP9P55211 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP9P55211 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP9P55211 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP9P55211 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP9P55211 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP9P55211 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP9P55211 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP9P55211 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP9P55211 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP9P55211 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP9P55211 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP9P55211 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP9P55211 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP9P55211 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP9P55211 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP9P55211 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP9P55211 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP9P55211 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP9P55211 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP9P55211 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP9P55211 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP9P55211 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP9P55211 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP9P55211 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP9P55211 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP9P55211 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP9P55211 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP9P55211 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP9P55211 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP9P55211 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP9P55211 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP9P55211 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP9P55211 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP9P55211 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP9P55211 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP9P55211 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP9P55211 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP9P55211 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP9P55211 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP9P55211 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP9P55211 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP9P55211 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP9P55211 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP9P55211 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP9P55211 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP9P55211 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP9P55211 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP9P55211 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP9P55211 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP9P55211 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP9P55211 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP9P55211 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP9P55211 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP9P55211 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP9P55211 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP9P55211 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP9P55211 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP9P55211 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP9P55211 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms