Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP12AP54707 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP12AP54707 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms