Protein–RNA interactions for Protein: P50395

GDI2, Rab GDP dissociation inhibitor beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDI2P50395 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDI2P50395 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDI2P50395 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDI2P50395 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDI2P50395 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDI2P50395 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDI2P50395 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDI2P50395 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDI2P50395 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDI2P50395 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDI2P50395 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDI2P50395 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GDI2P50395 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDI2P50395 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDI2P50395 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDI2P50395 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDI2P50395 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDI2P50395 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDI2P50395 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDI2P50395 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDI2P50395 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDI2P50395 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDI2P50395 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDI2P50395 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDI2P50395 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDI2P50395 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDI2P50395 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDI2P50395 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDI2P50395 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDI2P50395 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDI2P50395 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GDI2P50395 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDI2P50395 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDI2P50395 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDI2P50395 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDI2P50395 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDI2P50395 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDI2P50395 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDI2P50395 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDI2P50395 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDI2P50395 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDI2P50395 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDI2P50395 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GDI2P50395 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDI2P50395 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDI2P50395 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDI2P50395 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDI2P50395 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDI2P50395 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GDI2P50395 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDI2P50395 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDI2P50395 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDI2P50395 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDI2P50395 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDI2P50395 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDI2P50395 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDI2P50395 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDI2P50395 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDI2P50395 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDI2P50395 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDI2P50395 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDI2P50395 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDI2P50395 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDI2P50395 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDI2P50395 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDI2P50395 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDI2P50395 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDI2P50395 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDI2P50395 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDI2P50395 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDI2P50395 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDI2P50395 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDI2P50395 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDI2P50395 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GDI2P50395 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDI2P50395 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDI2P50395 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDI2P50395 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDI2P50395 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDI2P50395 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDI2P50395 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDI2P50395 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDI2P50395 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDI2P50395 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDI2P50395 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDI2P50395 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDI2P50395 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDI2P50395 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDI2P50395 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDI2P50395 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDI2P50395 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDI2P50395 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDI2P50395 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDI2P50395 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDI2P50395 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDI2P50395 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDI2P50395 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDI2P50395 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDI2P50395 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GDI2P50395 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms