Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPAP49450 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPAP49450 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPAP49450 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPAP49450 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPAP49450 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPAP49450 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPAP49450 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPAP49450 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPAP49450 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPAP49450 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPAP49450 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPAP49450 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPAP49450 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPAP49450 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPAP49450 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPAP49450 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPAP49450 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPAP49450 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPAP49450 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPAP49450 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPAP49450 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPAP49450 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPAP49450 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPAP49450 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPAP49450 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CENPAP49450 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CENPAP49450 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CENPAP49450 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CENPAP49450 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CENPAP49450 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CENPAP49450 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPAP49450 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPAP49450 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPAP49450 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPAP49450 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPAP49450 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPAP49450 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPAP49450 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPAP49450 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPAP49450 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPAP49450 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPAP49450 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPAP49450 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPAP49450 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPAP49450 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPAP49450 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPAP49450 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPAP49450 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPAP49450 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPAP49450 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPAP49450 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPAP49450 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPAP49450 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPAP49450 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPAP49450 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPAP49450 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPAP49450 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPAP49450 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPAP49450 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPAP49450 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPAP49450 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPAP49450 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPAP49450 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPAP49450 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPAP49450 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPAP49450 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPAP49450 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPAP49450 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPAP49450 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CENPAP49450 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPAP49450 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPAP49450 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPAP49450 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPAP49450 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPAP49450 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPAP49450 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPAP49450 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPAP49450 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPAP49450 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPAP49450 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPAP49450 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPAP49450 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPAP49450 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPAP49450 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPAP49450 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPAP49450 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPAP49450 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPAP49450 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPAP49450 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPAP49450 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPAP49450 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPAP49450 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPAP49450 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPAP49450 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPAP49450 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPAP49450 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPAP49450 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPAP49450 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CENPAP49450 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms