Protein–RNA interactions for Protein: P49005

POLD2, DNA polymerase delta subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD2P49005 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD2P49005 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD2P49005 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD2P49005 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD2P49005 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD2P49005 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD2P49005 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD2P49005 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD2P49005 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD2P49005 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD2P49005 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD2P49005 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD2P49005 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD2P49005 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD2P49005 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD2P49005 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD2P49005 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD2P49005 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD2P49005 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD2P49005 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD2P49005 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD2P49005 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD2P49005 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD2P49005 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD2P49005 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD2P49005 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD2P49005 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD2P49005 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD2P49005 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD2P49005 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD2P49005 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD2P49005 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD2P49005 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD2P49005 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD2P49005 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD2P49005 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD2P49005 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD2P49005 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD2P49005 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD2P49005 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLD2P49005 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD2P49005 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD2P49005 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD2P49005 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD2P49005 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD2P49005 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD2P49005 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD2P49005 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD2P49005 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD2P49005 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD2P49005 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD2P49005 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD2P49005 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD2P49005 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD2P49005 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD2P49005 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD2P49005 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD2P49005 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD2P49005 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD2P49005 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD2P49005 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD2P49005 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD2P49005 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD2P49005 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD2P49005 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD2P49005 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD2P49005 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD2P49005 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD2P49005 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD2P49005 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD2P49005 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD2P49005 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD2P49005 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD2P49005 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD2P49005 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD2P49005 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD2P49005 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD2P49005 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD2P49005 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD2P49005 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD2P49005 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD2P49005 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD2P49005 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD2P49005 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLD2P49005 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD2P49005 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD2P49005 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD2P49005 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD2P49005 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD2P49005 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD2P49005 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD2P49005 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD2P49005 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD2P49005 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD2P49005 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD2P49005 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD2P49005 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD2P49005 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD2P49005 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLD2P49005 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms