Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NESP48681 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NESP48681 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NESP48681 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NESP48681 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NESP48681 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
NESP48681 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NESP48681 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NESP48681 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NESP48681 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NESP48681 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NESP48681 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NESP48681 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NESP48681 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NESP48681 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
NESP48681 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NESP48681 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
NESP48681 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
NESP48681 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NESP48681 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NESP48681 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NESP48681 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NESP48681 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NESP48681 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NESP48681 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NESP48681 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NESP48681 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
NESP48681 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NESP48681 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NESP48681 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NESP48681 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NESP48681 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NESP48681 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NESP48681 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NESP48681 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NESP48681 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NESP48681 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NESP48681 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NESP48681 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NESP48681 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NESP48681 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NESP48681 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NESP48681 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NESP48681 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NESP48681 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
NESP48681 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NESP48681 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
NESP48681 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NESP48681 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NESP48681 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NESP48681 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NESP48681 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NESP48681 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NESP48681 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NESP48681 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NESP48681 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
NESP48681 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NESP48681 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NESP48681 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NESP48681 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NESP48681 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NESP48681 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NESP48681 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
NESP48681 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NESP48681 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NESP48681 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NESP48681 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NESP48681 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NESP48681 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NESP48681 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NESP48681 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NESP48681 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NESP48681 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NESP48681 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NESP48681 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NESP48681 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NESP48681 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NESP48681 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NESP48681 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NESP48681 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NESP48681 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NESP48681 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NESP48681 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NESP48681 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NESP48681 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NESP48681 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
NESP48681 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NESP48681 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NESP48681 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NESP48681 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NESP48681 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NESP48681 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NESP48681 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NESP48681 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NESP48681 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NESP48681 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NESP48681 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NESP48681 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NESP48681 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NESP48681 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms