Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SLC6A9P48067 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms