Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACTR1BP42025 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms