Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBRP36941 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBRP36941 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBRP36941 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBRP36941 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBRP36941 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBRP36941 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBRP36941 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBRP36941 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LTBRP36941 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LTBRP36941 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LTBRP36941 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LTBRP36941 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LTBRP36941 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LTBRP36941 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LTBRP36941 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LTBRP36941 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LTBRP36941 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LTBRP36941 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LTBRP36941 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LTBRP36941 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LTBRP36941 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LTBRP36941 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LTBRP36941 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LTBRP36941 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LTBRP36941 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LTBRP36941 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LTBRP36941 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LTBRP36941 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LTBRP36941 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LTBRP36941 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LTBRP36941 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LTBRP36941 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LTBRP36941 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LTBRP36941 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LTBRP36941 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LTBRP36941 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LTBRP36941 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LTBRP36941 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LTBRP36941 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LTBRP36941 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LTBRP36941 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LTBRP36941 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LTBRP36941 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LTBRP36941 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LTBRP36941 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LTBRP36941 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LTBRP36941 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LTBRP36941 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LTBRP36941 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LTBRP36941 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LTBRP36941 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LTBRP36941 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LTBRP36941 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LTBRP36941 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LTBRP36941 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LTBRP36941 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LTBRP36941 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LTBRP36941 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LTBRP36941 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LTBRP36941 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LTBRP36941 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LTBRP36941 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LTBRP36941 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LTBRP36941 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LTBRP36941 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LTBRP36941 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LTBRP36941 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBRP36941 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBRP36941 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBRP36941 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBRP36941 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBRP36941 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBRP36941 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBRP36941 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBRP36941 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBRP36941 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBRP36941 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBRP36941 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBRP36941 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBRP36941 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBRP36941 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBRP36941 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBRP36941 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBRP36941 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBRP36941 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBRP36941 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBRP36941 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBRP36941 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBRP36941 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBRP36941 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBRP36941 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBRP36941 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBRP36941 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBRP36941 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBRP36941 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBRP36941 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBRP36941 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBRP36941 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LTBRP36941 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms