Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TGFBR1P36897 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms