Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXD12P35452 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXD12P35452 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms