Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPC1P35052 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPC1P35052 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GPC1P35052 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPC1P35052 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPC1P35052 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPC1P35052 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GPC1P35052 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPC1P35052 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPC1P35052 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPC1P35052 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPC1P35052 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPC1P35052 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPC1P35052 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPC1P35052 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPC1P35052 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPC1P35052 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPC1P35052 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPC1P35052 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPC1P35052 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPC1P35052 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPC1P35052 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPC1P35052 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPC1P35052 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPC1P35052 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GPC1P35052 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPC1P35052 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPC1P35052 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPC1P35052 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPC1P35052 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPC1P35052 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPC1P35052 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPC1P35052 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPC1P35052 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPC1P35052 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPC1P35052 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPC1P35052 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPC1P35052 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPC1P35052 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GPC1P35052 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPC1P35052 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GPC1P35052 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPC1P35052 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GPC1P35052 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPC1P35052 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPC1P35052 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPC1P35052 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPC1P35052 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPC1P35052 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPC1P35052 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GPC1P35052 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPC1P35052 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPC1P35052 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPC1P35052 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GPC1P35052 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPC1P35052 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GPC1P35052 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPC1P35052 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPC1P35052 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPC1P35052 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPC1P35052 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPC1P35052 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPC1P35052 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPC1P35052 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPC1P35052 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GPC1P35052 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPC1P35052 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPC1P35052 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPC1P35052 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPC1P35052 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPC1P35052 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPC1P35052 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPC1P35052 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPC1P35052 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPC1P35052 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPC1P35052 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPC1P35052 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPC1P35052 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPC1P35052 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPC1P35052 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPC1P35052 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPC1P35052 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GPC1P35052 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPC1P35052 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GPC1P35052 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPC1P35052 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPC1P35052 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPC1P35052 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPC1P35052 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPC1P35052 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPC1P35052 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPC1P35052 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GPC1P35052 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPC1P35052 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPC1P35052 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPC1P35052 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPC1P35052 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPC1P35052 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPC1P35052 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GPC1P35052 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms