Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
ABCC1P33527 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCC1P33527 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms