Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSFA2P28290 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms