Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PLNP26678 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PLNP26678 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PLNP26678 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PLNP26678 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PLNP26678 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PLNP26678 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PLNP26678 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PLNP26678 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PLNP26678 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PLNP26678 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PLNP26678 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PLNP26678 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PLNP26678 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PLNP26678 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PLNP26678 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PLNP26678 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PLNP26678 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PLNP26678 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PLNP26678 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PLNP26678 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PLNP26678 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PLNP26678 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PLNP26678 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PLNP26678 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PLNP26678 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PLNP26678 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PLNP26678 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PLNP26678 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PLNP26678 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PLNP26678 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PLNP26678 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PLNP26678 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PLNP26678 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PLNP26678 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PLNP26678 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PLNP26678 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PLNP26678 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PLNP26678 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PLNP26678 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PLNP26678 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PLNP26678 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PLNP26678 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PLNP26678 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PLNP26678 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PLNP26678 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PLNP26678 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PLNP26678 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PLNP26678 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PLNP26678 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PLNP26678 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PLNP26678 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PLNP26678 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PLNP26678 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PLNP26678 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PLNP26678 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PLNP26678 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PLNP26678 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PLNP26678 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PLNP26678 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PLNP26678 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PLNP26678 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PLNP26678 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PLNP26678 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PLNP26678 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PLNP26678 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PLNP26678 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PLNP26678 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
PLNP26678 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PLNP26678 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PLNP26678 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PLNP26678 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PLNP26678 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PLNP26678 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PLNP26678 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PLNP26678 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PLNP26678 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PLNP26678 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PLNP26678 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PLNP26678 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PLNP26678 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PLNP26678 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PLNP26678 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PLNP26678 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PLNP26678 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PLNP26678 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PLNP26678 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PLNP26678 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PLNP26678 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PLNP26678 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PLNP26678 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PLNP26678 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PLNP26678 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PLNP26678 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PLNP26678 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PLNP26678 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PLNP26678 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PLNP26678 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
PLNP26678 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
PLNP26678 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms