Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NFKBIAP25963 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NFKBIAP25963 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms