Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO2P25791 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO2P25791 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO2P25791 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO2P25791 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO2P25791 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO2P25791 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO2P25791 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO2P25791 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO2P25791 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO2P25791 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO2P25791 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO2P25791 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO2P25791 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO2P25791 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO2P25791 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO2P25791 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO2P25791 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO2P25791 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO2P25791 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO2P25791 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO2P25791 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO2P25791 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO2P25791 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO2P25791 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO2P25791 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO2P25791 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO2P25791 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO2P25791 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO2P25791 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO2P25791 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO2P25791 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO2P25791 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO2P25791 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO2P25791 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO2P25791 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO2P25791 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO2P25791 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LMO2P25791 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LMO2P25791 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LMO2P25791 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LMO2P25791 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LMO2P25791 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LMO2P25791 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LMO2P25791 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMO2P25791 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMO2P25791 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMO2P25791 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMO2P25791 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMO2P25791 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMO2P25791 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMO2P25791 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMO2P25791 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMO2P25791 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LMO2P25791 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMO2P25791 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMO2P25791 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMO2P25791 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMO2P25791 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMO2P25791 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMO2P25791 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMO2P25791 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMO2P25791 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMO2P25791 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMO2P25791 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO2P25791 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO2P25791 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO2P25791 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO2P25791 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO2P25791 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO2P25791 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO2P25791 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO2P25791 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO2P25791 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO2P25791 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO2P25791 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO2P25791 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO2P25791 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO2P25791 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO2P25791 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO2P25791 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO2P25791 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO2P25791 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO2P25791 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO2P25791 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO2P25791 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO2P25791 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO2P25791 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO2P25791 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO2P25791 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO2P25791 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO2P25791 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO2P25791 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO2P25791 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO2P25791 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO2P25791 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO2P25791 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO2P25791 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO2P25791 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO2P25791 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms