Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMA4P25789 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms