Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PRKCHP24723 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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