Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTPRDP23468 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRDP23468 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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